清华大学smallRNA项目文章(IF:21)| 植物抗病毒新机制及其相应的病毒反防御机制
植物病毒可对作物的产量和品质造成巨大危害。同时植物也进化出多种防御机制对抗病毒的侵染。RNAi(RNA interference)是一种重要的抗病毒机制,在真核生物的先天免疫和基因调控中发挥重要作用。它通过小RNA(small RNA,sRNA)靶向基因mRNA从而干扰基因的表达。研究表明,被某些病毒侵染后,寄主植物会激活或上调多个RNAi相关基因的表达,但植物如何感知病毒侵染初始信号并激活RNAi通路的基因表达至今仍然未知。此外,RNAi基因的转录调控机制也仍然尚不明晰。
8月4日,清华大学生命学院刘玉乐课题组在国际著名期刊《细胞-宿主和微生物》(Cell Host & Microbe)上在线发表了题为“一个结合钙调蛋白的转录因子将钙信号与植物抗病毒RNAi防御联系起来”(A calmodulin-binding transcription factor links calcium signaling to antiviral RNAi defense in plants)的研究论文,报道了植物通过识别植物病毒侵染过程中保守的分子模式:创伤诱导的钙流,促进植物抗病毒RNAi防御,其中钙调蛋白结合转录因子CAMTA3通过激活RDR6、BN2基因的转录促进多个RNAi通路基因的表达,从而正向调控植物抗病毒RNAi过程的分子机制。诺禾致源在本研究中承担small RNA建库测序分析工作。
图1 camta3敲除的转基因16c本生烟中GFP表达增强,GFP产生的siRNA水平降低
图2 bn2敲除的转基因烟草中miR162、miR168、 miR403含量升高表明BN2可能在植物体内具有miRNA成熟体降解酶活性
诺禾致源拥有10年small RNA及非编码RNA关联分析技术服务经验,累计项目8000+,累计样本数40000+,更拥有UMI small RNA升级技术,起始量降至100 ng total RNA/文库。诺禾致源致力成为更专业的基因组学解决方案提供者,为您的科研工作保驾护航。
参考文献
Reference: Wang YJ, Gong Q, Wu YY, et al. A calmodulin-binding transcription factor links calcium signaling to antiviral RNAi defense in plants[J]. Cell Host & Microbe. 2021.
往期精彩推荐
RNA研究部 刘淼 | 文案